Nainen toivoo omaa pienokaista ja saakin noidalta siemenen, josta kasvaa pienen pieni tytto. Peukalon mittaisen tyton nimeksi tulee Peukalo-Liisa. Peukalo-Liisan sirous ja kauneus saattavat hanet pulaan, silla ruma sammakko haluaa hanesta pojalleen vaimon ja kidnappaa tyton. Peukalo-Liisan onnistuu kuitenkin paeta ystavallisten kalojen avustuksella. Peukalo-Liisan pakomatka on tynn ihmeellisi sattumuksia, pelottavia vaaranpaikkoja ja hyvntahtoisia auttajia. Matkallaan Peuko-Liisa kohtaa perhosia, turilaisia, peltohiiri, myyri sek pskysi ja nkee uusia kaukaisia paikkoja. Minne Peukalo-Liisan tie lopulta vie?
